WooCommerceの決済｜手数料と入れ方を公式の料金表で比べる。コンビニ払いとPayPayは「どのプラグインで入れるか」が先。PayPal・Stripe・Square・PayPay・Amazon Payを入れていた私の見方（計算機つき）

WooCommerceの決済 手数料・導入を比較 WooPayments・Stripe・PayPal・Square・Amazon Pay・KOMOJU PayPay・コンビニ対応 副業・起業・ネットショップ
2023.08.31

「WooCommerce 決済」「ウーコマース 決済 手数料」「WooCommerce 決済 導入」で調べて来られた方に、先に結論を書きます。

WooCommerceの決済は、①WooCommerceが出している「WooPayments」、②Stripe・PayPal・Square・Amazon Payなど決済会社ごとのプラグイン、③KOMOJUのような日本の決済代行、の3通りで入れます。カードの手数料は、2026年10月10日に確かめた公式の料金表で、多くが3.6%前後です（KOMOJUは3.25%に消費税が加わり、Amazon Payは物販で3.9%、PayPalは3.6%＋1件40円。WooPaymentsは3.6%で、手数料に消費税10%がかかると書いています）。コンビニ払いとPayPayは、Stripeの料金表に載っていても、WooCommerceのStripe拡張の対応一覧には入っていません。入れたいなら、KOMOJUなど対応しているプラグインを選びます。そして、どれを選んでも、カード決済には原則としてEMV 3-Dセキュアが、注文を確定する直前の画面には6つの表示が求められます。

私はWooCommerceで自分の店を持っていて、アンドロイドナビを1件5万円以上で売っていました。入れていた決済は、こうです。

「PayPal,Stripe,Square、PayPayとアマゾンペイも入れていた記憶がある」

決済で選ぶ前に、私がいちばん伝えたいのは、手数料の差ではなく、売る物のことです（5章）。

「法律に反する物を売るとアカウント停まるのでそれは避けるべき。CBDは一時期グレーだったが、結局塞がれた」

知りたいこと 答え 章
WooCommerceの決済の入れ方 WooPayments、決済会社ごとのプラグイン、日本の決済代行の3通り。銀行振込はWooCommerceに最初から入っている 2章
手数料はいくらか カードは多くが3.6%前後。KOMOJU 3.25%（別に消費税）、Amazon Pay（物販）3.9%、PayPal 3.6%＋40円 3章
コンビニ払い・PayPayを入れたい WooCommerceのStripe拡張の対応一覧にはない。KOMOJUなど対応しているプラグインで入れる 2章
選ぶ前に確かめる決まり EMV 3-Dセキュア、カード番号を持たない仕組み、注文確定の直前の画面の6つの表示、売る物の決まり 4章
筆者がいちばん伝えたいこと 法律に反する物を売るとアカウントが止まる 5章
自分の値段と件数で比べたい 1件・1か月・1年の手数料を計算機で出す 7章

1. 先に、立場を書きます

私は中古品の売買を20年近く続けている古物商で、BASE、STORES、WooCommerceで自分の店を作って回してきました。WooCommerceでは、時計の店を新しいドメインで始めて、店のページではなく記事から売りました（Shopifyで売れないのは店のせいではないに書いた話です）。1件5万円以上で売っていたのは、アンドロイドナビです。決済とのかかわりは、こうです。

入れていた決済 「PayPal,Stripe,Square、PayPayとアマゾンペイも入れていた記憶がある」
1件5万円以上で売っていた商品 「5万円以上」で売っていたのは「アンドロイドナビ」
決済まわりで困ったこと 「特にない」

料金と手順は、私が入れていた当時から変わっている可能性があるので、この記事では2026年10月10日に各社の公式のページで確かめた内容で書きます。

2. WooCommerceの決済の入れ方は、3通り（と、最初から入っている銀行振込）

入れ方 例 特徴
WooCommerceに最初から入っている支払い 銀行振込 決済会社を通さない。入金を確かめるのは自分
① WooCommerceが出している決済 WooPayments 導入費用・月額なし。カードやApple Payなど
② 決済会社ごとのプラグイン Stripe、PayPal、Square、Amazon Pay その会社のアカウントで受け取る。会社ごとに入れる
③ 日本の決済代行 KOMOJU 1つのプラグインで、カード・コンビニ・銀行振込・PayPayなどをまとめて入れる

2-1. WooCommerceに最初から入っている支払い：銀行振込

WooCommerceには、決済会社を通さない支払いが最初から入っています。銀行振込（WooCommerceの表記ではDirect Bank Transfer）は、WooCommerceの説明では「オフラインの支払い」で、注文は入金を確かめるまで「保留中（On hold）」になります。発送する前に、入金があって手続きが済んでいることを自分の口座で確かめるのが大事だ、と書いています。決済会社への手数料はかかりませんが、入金の確認と発送の判断は、自分の手作業です。

日本の銀行振込の表示、ゆうちょの振替、店頭払い、代金引換の手数料の計算などは、「Japanized for WooCommerce」というプラグイン（WordPress.orgで有効インストール1万以上）が加えます。

2-2. ① WooCommerceが出している決済：WooPayments

WooPaymentsは、WooCommerceが出している決済です。WooCommerceの日本向けのページは「導入費用や月額料金は一切かかりません」とし、カードやApple Payなどでの支払いを挙げています。料金表の日本の欄は、カードが3.60%、海外のカードは＋2.00%、通貨の換算は＋2.00%、不審請求（チャージバック）は1件1,500円で、手数料には消費税10%がかかる、と書いています。日本の欄に、コンビニ払いとPayPayの行はありません。

2-3. ② 決済会社ごとのプラグイン：Stripe・PayPal・Square・Amazon Pay

  • Stripe：WooCommerceのStripe拡張（WooCommerce Stripe Payment Gateway）で入れます。カードのほか、Apple Payなどの支払いを受けられます。ただし、拡張が対応する「追加の支払い方法」の一覧に、コンビニ払いとPayPayはありません。そして、Stripeの管理画面にはもっと多くの支払い方法が出るが、この一覧にないものを管理画面で有効にしても、プラグインには表示されない、と注意書きがあります。これはWooCommerceが出しているStripe拡張の話で、ほかの会社のプラグインや自分で組む連携は、この記事では確かめていません
  • PayPal：WooCommerceの拡張（WooCommerce PayPal Payments）があります。PayPalの料金は国内の取引で3.60%＋40円です。「PayPalオンラインカード決済サービス」は、申請してPayPalに承認される必要があり、そのカード・デビットカードの支払いは3.20%＋40円です
  • Square：Squareは日本向けのページで、WooCommerceとの連携のしかたを案内しています（2023年4月28日に一部更新）。ECサイトでのカード決済の手数料は3.6%で、カードのブランドで率は変わりません
  • Amazon Pay：WooCommerceの拡張（WooCommerce Amazon Pay）の説明は、店の所在地として使える国に日本を挙げています。Amazon Payの手数料は、物販とサービスで3.9%、デジタルコンテンツで4.5%です

2-4. コンビニ払いとPayPayは、「どのプラグインで入れるか」が先

コンビニ払いとPayPayは、料金表に載っているかと、WooCommerceで選べるかが別です。

  • Stripeの料金表には、コンビニ決済（3.6%、最低120円）とPayPay（3.98%）があります。しかし、2-3のとおり、WooCommerceのStripe拡張の対応一覧には入っていません
  • WooPaymentsの料金表の日本の欄にも、コンビニ払いとPayPayの行はありません
  • KOMOJUは、WooCommerce向けに「KOMOJU Payments」というプラグインを出していて、カード、コンビニ決済、PayPay、楽天ペイ、au PAY、メルペイ、ペイディ（あと払い）、銀行振込などを、1つのプラグインで入れられると案内しています。設定の手順は、プラグインを入れて有効にし、WooCommerceの店とKOMOJUのアカウントをつなぎ、表示したい支払い方法にチェックを入れる、の3つです。ただし、本番で使えるのは、申請してKOMOJUの審査と契約が済んでからです。KOMOJUのヘルプは、サイトも審査の対象で、特定商取引法に基づく表記、商品の内容と価格、決済までの流れが分かるページを用意するよう案内しています。決済手段をあとから足すときの申請の案内もあります
  • PayPayだけを入れるプラグインも、WordPress.orgにあります（Payment Gateway PayPay for WooCommerce）。作者は個人の開発者で、PayPay株式会社の公式とは書かれていません。PayPayの開発者アカウントが必要で、本番で使うには別のサイトで認証キーを買う必要がある、と書いています

私もPayPayを入れていた記憶があります（1章）。入れる前に、そのプラグインがPayPayに対応しているかを、プラグインの説明で確かめてください。

3. 手数料の比較：公式の料金表（2026年10月10日に確認）

3-1. カード

サービス 国内のカード 初期・月額 そのほか
WooPayments 3.60%（手数料に消費税10%） 導入費用・月額なし 海外のカード＋2.00%、通貨の換算＋2.00%、不審請求1件1,500円
Stripe 3.6% 初期費用・月額なし 通貨の換算が必要な場合＋2%、不審請求の申し立て1件1,500円
PayPal 3.60%＋40円 （料金のページに記載なし） PayPalオンラインカード決済サービスは承認制で3.20%＋40円。PayPalから銀行口座への引き出しは、1回5万円以上は無料、5万円以下は250円（ページの表記どおり）
Square オンライン3.6%（ブランドで変わらない） フリープランは月0円 振込手数料はSquareが負担。みずほ銀行・三井住友銀行は翌営業日、ほかの銀行は毎週金曜に入金
Amazon Pay 物販・サービス3.9%、デジタルコンテンツ4.5% 初期・月額無料 振込手数料は無料。率は売る商品の内容でAmazon Payが決め、見直すことがある
KOMOJU 3.25%（管理画面の率に、別に消費税が加わる） 初期・月額無料 国内口座への振込は1回220円（3万円未満）か410円（3万円以上）。週ごとの振込を選んでも追加料金はない。支払いが済んだ取引は、あとで返金しても決済手数料がかかる。特別な合意があればそちらが優先

3-2. コンビニ払い・PayPay・銀行振込

サービス コンビニ PayPay 銀行振込 WooCommerceで入れるとき
KOMOJU 2.75% 3.5%～ 1.4% KOMOJU Paymentsで入れられると案内している
Stripe 3.6%（最低120円） 3.98% 料金表にあり WooCommerceのStripe拡張の対応一覧に、コンビニ、PayPay、日本の銀行振込はない
WooCommerceの銀行振込 － － 決済会社の手数料なし 最初から入っている。入金の確認は自分

表の率は、標準の料金です。契約、売る物、取引の額によって変わることがあり、各社とも料金を変えることがあります。手数料に消費税が加わると書いているのは、WooPayments（10%）とKOMOJUです。7章の計算機では、WooPaymentsを3.96%（3.6%×1.1）、KOMOJUを3.575%（3.25%×1.1）で入れました。ほかの会社の率に消費税がかかるかは、各社の請求で確かめてください。

4. 選ぶ前に確かめること：日本の決まり

4-1. カード決済は、EMV 3-Dセキュアと、カード番号を持たない仕組みが求められる

クレジットカードの業界の協議会がまとめた「クレジットカード・セキュリティガイドライン」の5.0版は、「2025年3月末までに、原則、全てのEC加盟店にEMV 3-Dセキュアの導入を求めることとしている」と書いています。このガイドラインは、割賦販売法で義務付けられている措置の「実務上の指針」と位置づけられています。2025年3月の6.0版では、EC加盟店に、サイトの脆弱性への対策、不正ログインへの対策、EMV 3-Dセキュアの導入を求め、その前提として、カード情報を持たない仕組み（非保持化）か、PCI DSSへの準拠を挙げています。ガイドラインの「非保持化」は、自社で持つ機器やネットワークで、カード情報を「保存」「処理」「通過」しないことです（2026年3月の6.1版でも、対策の中身は変わっていません）。

WooCommerceの店でいえば、確かめることは次の3つです。

  • 入れるプラグインと決済会社の組み合わせが、EMV 3-Dセキュアに対応しているか
  • カード番号が、自分のサーバーに保存されず、処理もされず、通りもしない仕組みか（非保持化）。保存していないだけでは足りません。自分の入れ方がそれに当たるかを、決済会社に確かめる
  • WordPress、WooCommerce、プラグインを更新しているか（脆弱性への対策）

4-2. 注文を確定する直前の画面に、6つの事項を表示する

2022年6月1日から、特定商取引法の第12条の6で、通信販売の申込みの最終段階の画面（注文を確定するボタンを押す直前の画面）に、次の6つを表示することが決められています。消費者庁は、カートシステムを使うEC事業者に向けて、対応を確かめるよう案内しています。

  • 分量（商品の数量など）
  • 販売価格・対価
  • 支払の時期・方法
  • 引渡し・提供の時期
  • 申込みの期間（期限がある場合）
  • 申込みの撤回・解除に関すること

この表示に違反し、それで誤認して申し込んだ消費者は、申込みを取り消せることがあります（第15条の4）。見出しが6つ並んでいればよいわけではなく、中身が実際の契約（送料、返品の条件、支払いの期限など）と合っている必要があります。消費者庁のガイドラインには画面の例があるので、WooCommerceの注文画面と見比べて、テストの注文（8章）で自分の目で確かめてください。

4-3. 決済会社の審査で見られること

Stripeは、コンビニ決済の申し込みについて、次のどれかに当たると、提携先の金融機関とコンビニのチェーンが断ることがある、と書いています（一部）。

  • 支払いと注文の流れが、サイトで分かりやすく説明されていない
  • 事業者名・住所・メールアドレス・電話番号が、申し込みの内容と合わない、またはサイトにはっきり出ていない
  • 個人事業主で、サイトに店舗の写真がない
  • サポートの受付時間が書かれていない
  • 特定商取引法に基づく表記がない、または申し込みの内容と合わない
  • 送料や手数料など、追加でかかる費用が書かれていない
  • サイトが公開されていない、リンク切れや404がある

さらに、コンビニ決済には、Stripe全体の禁止業種とは別に、使えない業種が決められています。たとえば、事業を始めて3年未満の個人事業主、ゲーム内の通貨やキャラクターの売買（RMT）、稼ぐ方法や投資の情報を売る情報商材、個人輸入の代行（転送）、出会い系サイト、占い、電子たばこ・水たばこなどです。

4-4. 売る物の決まり

決済会社は、扱えない商品や業種を公開しています。法律に反していなくても、4-3の占いや出会い系のように、決済会社の規約で扱えない業種があります。

  • Stripe：禁止業種に、違法薬物、大麻製品、地域の法定の制限を超えたTHCを含むCBD商品、偽造品などを挙げています。微量のTHCだけを含むCBD製品は「制限付き業種」で、地域の規制に応じて扱いが決まります
  • PayPal：利用規定ポリシー（2022年11月2日更新）で、法律や規則に違反すること、麻薬・ステロイド・特定の規制物質・消費者の安全に危険をもたらす製品などを禁じ、違反はユーザー規約の違反になる、と書いています

無在庫販売と決済の関係は、無在庫転売は違法か（規約の原文）の3章に、PayPalとStripeの原文を引いてまとめています。

5. 私の見方：法律に反する物を売れば、アカウントが止まる

WooCommerceの決済について、私がいちばん伝えたいのは、これです。

「法律に反する物を売るとアカウント停まるのでそれは避けるべき。CBDは一時期グレーだったが、結局塞がれた」

4-3と4-4の決まりは、各社が公開しているものです。法律に反していなくても扱えない業種もあるので、どの決済を選ぶかより先に、自分が売る物がそこに当たらないかを確かめてください。

6. 5万円以上の物を売るときに見ること

私がアンドロイドナビを売っていた価格帯は、1件5万円以上でした。値段が高いと、次のところで差が出ます。

  • 手数料は値段に比例する：5万円の注文なら、3.6%で1,800円、PayPalの3.6%＋40円で1,840円、Amazon Payの3.9%で1,950円です。KOMOJUの3.25%は1,625円に消費税が加わり、WooPaymentsの3.6%は1,800円に消費税が加わります。件数が少なくても、1年では差が積み上がります。7章の計算機で、自分の値段と件数を入れて比べられます
  • コンビニ払いには上限がある：Stripeのコンビニ決済は、1回120円から300,000円までです
  • 不審請求（チャージバック）は、手数料より代金が重い：StripeとWooPaymentsの手数料は、申し立て1件につき1,500円です。ただしStripeの説明では、不審請求が始まると、代金と手数料が残高から引かれ、カード会社が利用者の側を認めれば代金は戻りません。受け付けの手数料は、勝っても戻りません。5万円の商品なら、問題になるのは1,500円より5万円のほうです
  • 銀行振込は決済会社の手数料がかからない：その代わり、入金を自分で確かめてから発送します（2-1）
  • 入金の受け取り方：PayPalから銀行口座への引き出しは、1回5万円以上なら無料です。Square、Amazon Payは振込手数料を負担すると書いています。KOMOJUは国内口座への振込1回ごとに220円か410円です

私の店では、決済まわりで困ったことは「特にない」でした。

7. 計算ツール：決済の手数料を、1件・1か月・1年で比べる

商品の値段と1か月の件数から、決済サービスごとの手数料を、1件・1か月・1年で出します。初めの5万円は、私がアンドロイドナビを売っていた価格帯（5万円以上）の下限から置いた例で、月10件は計算のための例です。

決済サービスごとの手数料を、1件・1か月・1年で比べる

率は2026年10月10日に各社の公式の料金表で確かめたカードの標準の率です（3章）。WooPaymentsとKOMOJUは、手数料に消費税が加わると書いているので、消費税を足した率にしてあります。契約や商品の種類で変わるので、自分の契約の率に書き換えてください。商品の値段と件数は計算の例です。

決済サービス 率（%） 1件ごとの固定額（円）

率の欄は、3章のカードの標準の率です（WooPaymentsとKOMOJUは消費税を足した率）。自分の契約の率や、コンビニ払い・PayPayの率に書き換えて使えます。決済サービスの名前を消すと、その行は計算から外れます。

8. 入れたら、テストの支払いをしてから公開する

  • WooPayments：申し込みのときに「Test payments」を選ぶと、実在の情報を使わないテスト用のアカウントが作られます。テスト用のアカウントでは本番の支払いは受けられず、本番のアカウントに切り替えると、テスト用のアカウントは消えます
  • Stripe：テストのときは、テスト用のカード番号（例：4242 4242 4242 4242、有効期限は未来の日付、セキュリティコードは任意の3桁）を使います。本番の環境で本物のカード情報を使ってテストすることは、Stripeのサービス契約で禁じられています。本人確認の画面（3Dセキュア）を試すには、3Dセキュア用のテストカード（例：4000 0000 0000 3220）を使います
  • どの決済でも：注文を確定する直前の画面に4-2の6つが出ているか、注文の状態（銀行振込なら「保留中」）、届くメールの内容を、テストの注文で確かめます。コンビニ払いや銀行振込のように、注文のあとで払う方法は、払う前と払ったあとで注文の状態が変わるかも見ます。返金も1回試し、WooCommerceの注文と決済会社の管理画面の両方で返金になっているかを確かめます
  • 本番に切り替えたあと：テスト用の設定が残っていないかを確かめます

9. よくある質問

WooCommerceの決済方法には、何がありますか？

最初から入っている銀行振込（決済会社を通さない）と、WooCommerceが出しているWooPayments、Stripe・PayPal・Square・Amazon Payなど決済会社ごとのプラグイン、KOMOJUのような日本の決済代行のプラグインがあります（2章）。

WooCommerceの決済手数料はいくらですか？

手数料は、使う決済サービスごとにかかります。カードは、2026年10月10日に確かめた公式の料金表で、WooPayments 3.60%（手数料に消費税10%）、Stripe 3.6%、PayPal 3.60%＋40円、Square 3.6%、Amazon Pay 3.9%（物販）、KOMOJU 3.25%（別に消費税）です。振込や返金の手数料は会社で違います（3章）。

WooCommerceでPayPayは使えますか？

KOMOJUの案内では使えます。ただし、WooCommerceのStripe拡張の対応一覧にPayPayはなく、WooPaymentsの日本の料金表にも行がありません。KOMOJUはKOMOJU PaymentsでPayPayを入れられると案内しています。PayPayだけのプラグインもありますが、PayPay株式会社の公式とは書かれていません（2-4）。

コンビニ払いを入れるには？

KOMOJUなど、コンビニ払いに対応しているプラグインで入れます。Stripeの料金表にはコンビニ決済がありますが、WooCommerceのStripe拡張の対応一覧には入っていません（2-4）。

WooPaymentsとStripe、どちらが安いですか？

公式の料金表では、国内のカードはどちらも3.6%で、WooPaymentsは手数料に消費税10%がかかると書いています。不審請求の手数料は、どちらも1件1,500円です（3章）。

10. まとめ

  • 入れ方は3通り。WooPayments、決済会社ごとのプラグイン、日本の決済代行。銀行振込は最初から入っている
  • カードの手数料は多くが3.6%前後。KOMOJU 3.25%（別に消費税）、Amazon Pay（物販）3.9%、PayPal 3.6%＋40円。WooPaymentsは手数料に消費税10%
  • コンビニ払いとPayPayは、プラグインの対応で決まる。WooCommerceのStripe拡張の対応一覧にはない
  • カード決済にはEMV 3-Dセキュアと非保持化、注文確定の直前の画面には6つの表示。法律に反していなくても、決済会社の規約で扱えない業種がある
  • 私の見方は「法律に反する物を売るとアカウント停まるのでそれは避けるべき」。CBDは「一時期グレーだったが、結局塞がれた」

11. 出典

（いずれも2026年10月10日に確認）

12. あわせて読む

記事 どんなときに
WooCommerceのインストールと基本設定 WooCommerceをこれから入れるとき
Shopifyで売れないのは店のせいではない 店を作ったのに売れないとき
ECサイト運営に向いてる人は、3つの数字で決まる 自分の店を続けられるかを数字で見たいとき
Yahoo!ショッピング有料化で解約した モールから自分の店に移るかを考えるとき
STORESとは WordPressを使わずに店を作るとき
無在庫転売は違法か（規約の原文） 無在庫で売ると決済が止まるかを確かめるとき

13. この記事について

書いた人 中古品の売買を20年近く続けてきた古物商。BASE、STORES、WooCommerceで自分の店を回してきた
確かめた日 2026年10月10日（WooCommerce・WordPress.org・Stripe・PayPal・Square・Amazon Pay・KOMOJUの公式のページ、クレジット取引セキュリティ対策協議会のガイドライン、消費者庁のガイドラインとお知らせ）
私の経験から書いたこと WooCommerceの店でPayPal・Stripe・Square、PayPayとAmazon Payも入れていた記憶があること、アンドロイドナビを1件5万円以上で売っていたこと、決済まわりで困ったことは特にないこと、法律に反する物を売るとアカウントが止まるという見方と、CBDについての見方、WooCommerceで時計の店が記事から売れたこと
書かなかったこと PayPayをどの方法で入れたか、当時の手数料、決済会社の審査を通る方法、プラグインの細かい設定（会社とプラグインの更新で変わるため）
更新 2023年8月の記事を、2026年10月に作り直しました

 

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